Dalam usia yang masih relatif muda, SMP Muhammadiyah 12 GKB Gresik berhasil mengukir prestasi yang membanggakan. Bukan hanya dalam bidang akademik, bidang nonakademik juga berhasil disabetnya.

            Kemampuan nonakademik siswa mampu berbicara banyak pada level kabupaten, Jawa Timur, dan tingkat Nasional. Hal inilah yang menjadi kebanggaan sekolah yang seluruh siswa.

Beberapa prestasi sekolah yang telah diraih dengan sebuh prestasi:

1.   Ditetapkan sebagai sekolah RSBI (Rintisan Sekolah Bertaraf Internasional) oleh Direktorat PSMP Dikdiknas.

2.   Meraih Sertifikat ISO 9001 : 2000 dari LRQA tahun 2008

3.   The Best Writer Deteksi Jawa Pos tahun 2005, 2007 dan 2008

4.   Top Ten Mading Deteksi Jawa Pos tahun 2006, 2007 dan 2008

5.   Juara I Putri Lingkungan Hidup Kabupaten Gresik tahun 2007

6.   Juara II Olimpiade Fisika pada Olycon PWM Jawa Timur tahun 2006

7.   Juara I Olimpiade Matematika Kabupaten Gresik tahun 2007 

8.   5 besar penyaji terbaik Festival se-Jawa Timur Dinas Pendidikan dan Kebudayaan tahun 2009

9.   The Best Writer Deteksi Jawa Pos dan berkesempatan home stay in Australia tahun 2009

10.  Juara 1 Lomba guru tingkat Nasional dalam ajang Lomba Kreativitas Guru (LKG) yang diadakan oleh Direktorat Profesi Pendidik, Direktorat Jenderal Peningkatan Mutu Pendidik dan Tenaga Kependidikan Departemen Pendidikan Nasional